1、分離方法適用于哪些種類樣品中的外泌體提???
可用于細胞上清液、血清、血漿、尿液及其他低密度體液(如腦脊液、腹水、羊水、乳汁、唾液等)的外泌體提取。
2、樣品在提取外泌體之前是否可以低溫保存?
可以。血樣、尿樣、體液等,需要攢齊了一起提取,或者同一個患者的樣本多次提取。凍存前,首先要離心去除細胞和血小板,再將樣品分裝凍存于-20或-80℃。但如果有條件最好還是用新鮮樣品立即進行提取。長期請保存于-80℃,無須加凍存液;短期(1-2天內)則保存于4℃即可。
3、外泌體提取后是否可以凍存?
可以。使用硅化E.P.管或凍存管,減少exosome的粘附。Exosome能夠承受反復凍融,建議分裝,避免多次反復凍融。對于一些功能性實驗,建議不要凍存,直接使用新鮮提取或保存在4℃懸浮于PBS 中的exosome。4℃保存不超過一周,-80℃條件下可長期保存。
4、需要從血漿中分離外泌體,可以使用肝素或EDTA管去收集血液樣本嗎?
不可以。肝素將會大大損害接下來的RNA實驗。EDTA也許會干擾PCR 實驗。使用無肝素無EDTA管去收集血液樣本。立即離心樣品收集血漿用于exosome分離。如果必須使用抗凝劑,用EDTA管收集血液。如果有必要的話在接下來的PCR反應中調整Mg++的濃度。采血管的選擇:血漿(plasma):紫蓋采血管;血清(serum):黃蓋采血管(促凝管或促凝管帶分離膠)。
5、粘度過大的樣品如何處理?
如果樣品粘度過大時(因細胞分泌物較多所致),可將樣品用1×PBS緩沖液進行等體積稀釋。
6、培養細胞時,如何去除血清來源的外泌體?
多數情況下,細胞在體外培時養需要血清,而血清中一般都含有外泌體,為避免血清對細胞外泌體的污染,可采用以下兩種方法:
(1)將細胞培養用的血清通過1×105g超速離心10h以去除血清外泌體;
(2)選擇無血清培養基進行細胞培養。
7、無外泌體血清培養基(或者無血清培養基)在什么時候使用?
細胞在正常含血清的培養基中培養一定的時間后,細胞融合度約為60%-70%時,移去原有含血清的培養基,換成新鮮的無外泌體血清培養基(或者無血清培養基),繼續培養24-48h,細胞融合度達到80%-95%左右時收取上清,該上清液即可用于提取外泌體。
8、細胞培養過程中的死細胞是否會影響外泌體的提???
會的。在收獲細胞時,應確定死亡細胞占比不超過5%。細胞凋亡/死亡過程中會釋放大量大小不等的囊泡,它們在外泌體的提取純化過程中會污染活細胞產生的外泌體。
9、如何鑒定提取的外泌體?
通常使用透射電鏡檢測(形態)、粒徑檢測(大?。?、Western blot檢測等方法鑒定提取的外泌體。在進行Western blot檢測時,通常檢測外泌體標志蛋白(CD63、CD9、CD81、TSG101等)。
10、準備做細胞外泌體Small RNA的NGS測序,初始樣品量需要準備多少?
普通腫瘤細胞系推薦使用40mL以上的初始樣品量。由于某些細胞(如懸浮細胞、干細胞、神經細胞等)中外泌體含量比較低,建議先通過10kD超濾柱濃縮,準備40mL以上的濃縮液再進行超速離心分離外泌體。
11、進行外泌體RNA RT-PCR實驗推薦什么內參?
取決于具體樣品,可以選擇外源添加cel-miR-39-3p,或內源U6、SNORD61、SNORD68、SNORD72作為內參。
12、提取的外泌體進行Western blot前是否需要加入RIPA試劑裂解?
需要,一般按照1:1的比例加入RIPA試劑。
13、進行外泌體Western blot鑒定時有無內參蛋白可供選擇?
無,該檢測屬于定性檢測。
14、組織細胞外泌體如何提???
無菌環境下將組織剪成小塊(越小越好),然后在無血清的培養基中培養12h;將培養液轉移至離心管中,于4℃以3000g離心20 min去除培養液中雜質和細胞碎片,將上清液轉移至新的離心管中;先使用0.45μm濾器過濾上清液,接著使用0.2μm濾器過濾上清液,再進行超速離心分離外泌體。
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